在土壤领域，陆续有科学家利用计算机断层扫描设备对土壤孔隙结构等进行了研究，例如为探明不同土壤结构改良措施（秸秆覆盖、免耕、有机肥、保水剂）对土壤孔隙特征及分布的影响，采用计算机断层扫描法定量分析了土壤孔隙的数目、孔隙度及孔隙在土壤剖面上的分布特征。结果表明：不同措施均提高了土壤总孔隙数、大孔隙数及0.13～1.0 mm孔隙数，且其孔隙度也相应提高。同时孔隙成圆率也得到了。各处理中以有机肥和免耕处理效果较佳，其次为保水剂和秸秆覆盖，对照较低。此外，不同措施显著提高了土壤的田间持水量和＞0.25 mm 水稳性团聚体含量，降低了土壤容重，且各处理中，仍以有机肥和免耕处理效果较佳，其田间持水量分别较对照提高了15.9%和16.4%，而土壤容重较对照降低了6.8%和8.8%。相关分析表明：田间持水量、容重和＞0.25 mm水稳性团聚体含量与土壤总孔隙度和大孔隙度呈显著或较显著正相关；而土壤容重对于总孔隙度和大孔隙度及孔隙成圆率呈显著负相关。

    土壤结构包含了土壤颗粒、团聚体和孔隙等内容,其对土壤水、气、养分运动和生物活动具有重要作用,是土壤质量的核心指标。应用脱硫副产物改良碱化土壤的核心问题即是包括土壤结构在内的土壤质量，有中国农业大学研究人员通过在内蒙古河套灌区进行的多年期碱化土壤改良田问试验和室内试验,分析了不同改良处理下土壤理化性质的年内年际变化和作物产量,引入分形和多重分形理论研究了土壤团聚体和土壤粒径分布的变化特征,利用计算机断层扫描技术(CT)和数字图像处理技术,研究了改良措施对不同质地、不同深度碱化土壤基于图像分析得到的二维、三维孔隙结构的影响,并初步建立了基于土壤结构的土壤质量评价方式。

    另外来自中国科学院的学者对近些年土壤固碳进行了研究，在诸多影响土壤固碳的因素中，团聚体结构对土壤有机碳的物理保护机制是研究的焦点，土壤中原始有机碳在土壤团聚体和团聚体结构形成中发挥着不可替代的作用，土地利用方式、耕作方式以及施肥措施发生变化后，团聚体及其结构在土壤有机碳固定中的作用变得较加凸显。团聚体结构包含众多的孔隙，这些孔隙的大小、数量、形状以及空间分布等都会影响土壤中水分运移、植物根系生长、土壤生物活动以及土壤有机碳分配，它们相互作用影响土壤中有机碳的固定。作者分析了水分、植物根系以及土壤生物与团聚体孔隙结构之间的关系，阐述了这些因素在土壤有机碳变化中所起的作用。

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