到目前为止，根部和块根仅可通过挖出来的方式来观察。采用此不可逆分析方法，仅可通过统计学方法来评估与时间相关的信息。去年一年里，工业计算机断层扫描技术（CT）在地下结构分析中得到了日益广泛的应用。

该方法是一种新的表型研究技术。通过图像分割，有可能将相关结构与其周围环境区分，实现土壤地下结构3D成像。

此可视化技术呈现出真实状态，在不同时间点可对相同植物进行分析。无需将根挖出、无需破坏植物即可观测体积增加，分析地下的3维根结构或块茎结构。

成像技术不仅仅限于地下结构。人们在对植物各组织深入进行科研时，遇到了新的疑难问题。到目前为止，很多光学方法还不能用来进行特性的研究，仅可通过无损方法来测定，例如果实、种子等，在研究植物种子时，很难在不破坏种子的前提下探索其内部结构的变化。目前上使用的很多研究种子的技术大多是利用荧光法研究种子活力或其萌发率，这些方法能够高通量地达到某些研究目的，但始终无法得知种皮内部的结构和动态变化过程。人们研究植物根系时，会遇到很多困难。传统的洗根扫描法确实能够清晰地将根系展现在人们眼前，但却破坏了其原有的状态；微根窗法能够解决原位测量的问题，但却不能探索土壤内部的根系分布；因此如何能够原位观测土壤中的根系变化成了阻挠广大科研工作者的难题。即便是有一种方法能够探测到土壤中的根系变化，那土壤是否会对根系的研究产生干扰？此外，如果人们需要研究植物茎杆，是否存在一种无损的方法探索其内部结构？

解决这些难题，德国先进研究所Frauhofer推出了专门用于植物研究的CT三维成像系统，可对植物组织、果实、种子及土壤中的根系进行三维成像分析，无需专业的图像处理知识，可获取形态学以及内部性状信息;CT分为便携式、台式、落地式以及高通量模式。

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