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MRI与CT技术在土壤根系统3D成像的比较:根性状定量潜力与挑战

发表时间:2018-04-08 14:12:50点击:3128

来源:北京博普特科技有限公司

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摘要
 
背景:根是植物土壤生长、水分和养料吸收的关键器官。在资源受限条件下,根性能对植物生长、产量至关重要。

根发育与土壤基质互作较强,急需工具来在非透明土壤中对根生长进行3D观察和定量研究。当前两种技术适合此类研究:X射线断层扫描技术(CT)和核磁共振成像技术(MRI)。因其物理原理不同,此两种方法在根表型研究中有特定的潜力和挑战。我们将这两种方法做了对比:对生长在3种不同花盆,内径分别为34mm、56mm、81mm的花盆的根进行研究。

图片4.jpg

图1: 小花盆中的土壤和菜豆根的CT 和 MRI 图像。 相同植株生长在充满土的花盆里,内径(I.D.) 为34 mm,高200 mm ,先后经CT和MRI拍照。 (a) 图显示了花盆材料内的土壤柱上部,CT(灰度值)进行拍照,,体素为  28 × 28 × 28 μm3 ,拍摄部位为菜豆根 (Phaseolus vulgaris L.) ,以红色标识。 (b) 相同CT图像的根分割(a) ,体素为 56 × 56 × 56 μm3。 (c) 显示了相同根系1天后经由MRI的成像效果,体素为 333 × 333 × 1000 μm3 ,较后的值代表垂直尺寸。箭头指示了两幅图像中的相同的根。DAS:播种后数天,比例尺: 10 mm.


结果:两种方法均可成功对2周龄、置于3种不同尺寸花盆中豆类植物的根进行成像。小花盆中,CT和MRI法获得了相同根图像以及近似根长的信息,但与MRI法相比,CT图像呈现了较多的根细节信息。对中等尺寸的花盆而言,MRI显示了较多根,根的长度较长,但其中一些细根仅用CT才可观察到,高水含量对CT影响要大于MRI。对大花盆而言,与CT相比,MRI检测到了较多的根,包括根分支。

结论:两种技术在观察小直径花盆时,表现同样良好,均适合监测幼苗的根发育。要研究特定的根细节或细微渐变的细根的直径,CT优势明显,因其提供了高空间分辨率。对大花盆而言,MRI与CT相比,对根的研究较好些,原因可能在于MRI能取得较好的根与土壤对比效果。CT和MRI可一起互补采集信息,将两种方法进行组合可开启全新研究可能,例如在不同土壤结构中火不同土壤湿度下对根系统进行分析。

关键词:X射线计算机断层扫描技术(CT),核磁共振成像(MRI),根系统结构,菜豆((Phaseolus vulgaris  L.)3D成像,土壤根系,无损。
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