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Plant Phenomics | 基于根提拉力和X射线成像的玉米根系结构表型研究
发表时间:2021-12-07 09:49:43点击:932
来源:植物表型组学
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根系不仅是绝大多数陆生植物赖以生存的基础,还是提高作物抗逆性、养分积累和产量的重要抓手之一。对玉米而言,整个主根、侧根、冠根共同形成了一个复杂的系统,控制着植株汲水、觅养和抗倒伏的能力。尽管目前已有不少根系表型新方法,但在田间试验中,最常用的方法仍是提取测量根系上部(根冠),接着基于人工测量或二维成像技术进行性状量化,如PSTOL1、DRO1、土壤取芯、根提拉力测量等。然而,二维的表型技术受单一视角限制,无法达到足够高的准确度。
根提拉力测量法由于操作简便,常用于实地测量中,因而也具备大规模表型分析的潜力。根提拉力通常与根系生物量和分枝大小有关,但目前尚未有研究证实根提拉力与目前常用的根系结构测量数据间的关联。
近日,Plant Phenomics在线发表了题为Complementary Phenotyping of Maize Root System Architecture by Root Pulling Force and X-Ray Imaging的研究论文。
针对以上问题,该文章使用X射线计算机断层扫描(CT)技术,扫描生成高精度玉米根冠三维模型,并建立了能够同时测量71个特征的处理方法(Figure 1)。该方法改进了估测根系结构遗传贡献的流程,且具有极高的精度,能够全局检测根系结构生长发育的各种变化或者由环境变化而产生的根系分布的细微变化(Figure 2)。论文结果表明,根提拉力测量是一种高通量的根系形状提取方法,可估计根系质量,并且与该文方法中的多个三维特征显著相关(Figure 3)。总而言之,该文提出的方法能够用于校准和解读多种试验场景下的根提拉力测量值,并且能够辅助对根系结构的遗传研究工作。
Figure1:Pipeline for 3D root imaging using X-ray computed tomography.
Figure2:RPF and 3D global root system architecture traits are affected by genotype, environment, and developmental time point.
Figure3:RPF and 3D root system architecture traits are strongly associated with each other and root mass (grams).
论文链接
https://spj.sciencemag.org/journals/plantphenomics/2021/9859254/
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About Plant Phenomics
《植物表型组学》(Plant Phenomics)是由南京农业大学和美国科学促进会(AAAS)合作创办的英文学术期刊,于2019年1月正式上线发行,是Science合作出版的第二本期刊。采用开放获取形式,刊载植物表型组学交叉学科热点领域具有突破性科研进展的原创性研究论文、综述、数据集和观点。具体范围涵盖高通量表型分析的最新技术,基于图像分析和机器学习的表型分析研究,提取表型信息的新算法,作物栽培、植物育种和农业实践中的表型组学新应用,与植物表型相结合的分子生物学、植物生理学、统计学、作物模型和其他组学研究,表型组学相关的植物生物学等。期刊已被DOAJ、Scopus、PMC、EI和SCIE等数据库收录。
说明:本文由《植物表型组学》编辑部负责组稿。
中文内容仅供参考,一切内容以英文原版为准。
编辑:张威(实习)
审核:卞越、孔敏