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实验室植物CT表型成像系统-植物、果实、种子、根系、土壤研究
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来源:北京博普特科技有限公司
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科学家对植物各组织深入进行科研时,遇到了新的疑难问题。例如研究植物种子时,很难无损探索种子内部结构的变化。目前上使用的很多研究种子的先进技术大多是利用荧光法研究种子活力或其萌发率,这些方法能够高通量地达到某些研究目的,但始终无法得知种皮内部的结构和动态变化过程。再如,人们研究植物根系时,会遇到很多困难。传统的洗根扫描法确实能够清晰地将根系展现在人们眼前,但却破坏了其原有的状态;微根窗法能够解决原位测量的问题,但却不能探索土壤内部的根系分布;因此如何能够原位观测土壤中的根系变化成了阻挠广大科研工作者的难题。即便是有一种方法能够探测到土壤中的根系变化,那土壤是否会对根系的研究产生干扰?此外,如果人们需要研究植物茎杆,是否存在一种无损的方法探索其内部结构?如何研究种植于花盆中的根茎如马铃薯、番薯等以及生长于土壤中的花生种子?
为解决这些难题,德国先进研究所Frauhofner推出了专门用于植物研究的实验室CT三维断层扫描成像系统,可对植物组织、果实、种子及土壤中的根系进行三维成像分析,无需专业的图像处理知识,可获取形态学以及内部性状信息。
实验室CT断层扫描系统的工作程序是这样的:它根据植物不同组织对X线的吸收与透过率的不同,应用灵敏度较高的仪器对植物进行测量,然后将测量所获取的数据输入计算机,计算机对数据进行处理后,就可摄下检测区域植物组织的断面或立体图像,发现任何部位的细小变化。
室植物CT成像系统广泛应用于植物对植物根系、茎杆的内部结构变化的研究。可以无损地探索盆栽中不同植物的根系变化,也可以测量茎杆的3D结构。
该实验CT断层扫描系统对硬件要求较高,采用了Fraunhofer开发的Volex 软件系统,标准3D CT扫描程序供线上线下数据库的构建,自动修正减少环状伪影、预估旋转中心,另外采用Fraunhofer VolumePlayer (VP)来进行应用于2D、3D灰度值图像数据(8-Bit, 16-Bit 和 32-Bit )的分析和可视化。提供客户需要的结构模块和可扩展模块。提到的标准配置有:可视化数据层,利用直方图、本地统计、手动图像、灰度值分布、查询表、测量工具等手动图像分析,体积数据作为图像序列生成,视角连接,处理8-bit, 16-bit和浮点值,实时处理3D数据生成三维显示,不同的显示方法,图像叠加,红蓝眼镜可视3D图像。数据分析:重建的体积是在测量后手动的进行分析,分析软件由Fraunhofer VolumePlayer的插件进行,测量结果是被分离的根系系统,客户可以付费增加新的分析。
北京博普特科技有限公司作为计算机断层扫描表型成像系统的中国总代理,全面负责其系列产品在中国的市场推广和销售。