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种子表型组学:开心果基因组和果仁发育

发表时间:2024-07-30 17:19:38点击:78

来源:北京博普特科技有限公司

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Videometer Lab4多光谱种子表型成像系统是丹麦理工大学与丹麦Videometer公司开发,是用于种子研究的多光谱表型成像设备,典型客户为ISTA国际种子检验协会、ESTA欧洲种子检验协会、John Innes Centre、LGC化学家集团、奥胡斯大学等等,利用该系统发表的文章已经超过300篇。

Videometer种子表型表型成像系统可测量种子如尺寸、颜色、形状等,间接测定种子参数如种子纯度、发芽百分比、发芽率、种子健康度、种子成熟度、寿命等。种子活力综合种子活力是种子发芽和出苗率、幼苗生长的潜势、植株抗逆能力和生产潜力的总和(发芽和出苗期间的活性水平与行为),是种子品质的重要指标,具体包括吸涨后旺盛的代谢强度、出苗能力、抗逆性、发芽速度及同步性、幼苗发育与产量潜力。种子活力是植物的重要表型特征,传统检测方法包括低温测试、高温加速衰老测试、幼苗生长测定等。

该系统也可以对细菌、虫卵、真菌等进行高通量成像测量,进行病理学、毒理学或其它研究。对于拟南芥等冠层平展的植物,可以进行自动的叶片计数等。

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开心果基因组和果仁发育

摘要

开心果是一种可持续的坚果作物,具有卓越的气候适应能力和营养价值。为了推进开心果作为未来食物来源和硬壳水果的模型系统,我们生成了最广泛生长的开心果品种(Pistacia vera 'Kerman')的染色体规模参考基因组,并对壳、壳和果仁进行了时空发育研究。我们的研究通过整合来自三个生长季节二十四个时间点的数千种坚果的组织水平生理和分子数据,定义了开心果生长和成熟的四个不同阶段。果仁的转录和代谢变化阐明了控制营养质量的分子途径,例如不饱和脂肪酸的积累,这对保质期和膳食价值至关重要。这项工作产生了新的知识和资源,将为其他木本作物提供信息,并促进开心果作为一种具有全球意义、可持续和营养丰富的作物的进一步改良。

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In a nutshell: pistachio genome and kernel development

Abstract

Pistachio is a sustainable nut crop with exceptional climate resilience and nutritional value. To advance pistachios as a future food source and a model system for hard-shelled fruits, we generated a chromosome-scale reference genome of the most widely grown pistachio cultivar (Pistacia vera ‘Kerman’) and a spatiotemporal developmental study of the hull, shell, and kernel. Our study defined four distinct stages of pistachio growth and maturation by integrating tissue- level physiological and molecular data from thousands of nuts across twenty-four time points over three growing seasons. Transcriptional and metabolic changes in the kernel elucidate molecular pathways governing nutritional quality, such as the accumulation of unsaturated fatty acids, which are vital for shelf-life and dietary value. This work yields new knowledge and resources that will inform other woody crops and facilitate further improvement of pistachio as a globally significant, sustainable, and nutritious crop

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